《明朝時代》中各種靈石都具有獨特的功能，「靈石」是遊戲一大特色，然而，大家都不知道「靈石」背後隱藏著的秘密。這些寶石從世界各地由絲綢之路進入東土，各主城可以將這些靈石通過生化手段合成更高級的寶石，最後將其鑲嵌的裝備上增加各種屬性。

「靈石」主要的神奇功效在於提高將領或士兵各種戰鬥能力，而攻擊力象徵著一支隊伍的戰鬥力，是最主要的戰鬥需要。將領的統領能力是兵力攻擊力度的首要前提，「統帥符石」只能鑲嵌在飾品上，即項鍊或戒指。統帥符石可以提升將領的統領能力，6級的統帥符石可使將領的統率+27。

「攻擊符石」是提高將領攻擊的靈石，它可以鑲嵌在武器、防具和飾品上，其不能提高將領所帶領部隊士兵的攻擊力度，但正所謂只有強大的將領才能統帥士兵，因此將領的攻擊力極為重要。6級攻擊符石可使將領的攻擊+65。

提高了將領攻擊力度，接下來就該提高將領所帶部隊的攻擊了。「銳金石」鑲嵌在武器、防具或飾品上，可以增加將領所帶部隊的攻擊。6級銳金石可使部隊的攻擊+121。

「玄陰石」可以增加將領所帶部隊的連擊率，這是戰鬥的更深層次攻擊，連擊可以使敵人沒有還手的餘地。「玄陰石」只能鑲嵌在武器和飾品上，6級玄陰石可使部隊的連擊率+6。

「迅雷石」可以增加領所帶部隊的機動，「迅雷石」鑲嵌在武器或飾品上，使士兵對敵方攻擊的速度更快，正所謂先下手為強，有時候搶先出手就是制勝的關鍵。6級迅雷石可使部隊的機動力+6。

在戰鬥中，部隊的瞄準和命中率相當重要，而「明目石」就為部隊的命中率指引的方向。「明目石」鑲嵌在武器、防具或飾品上，可以增加將領所帶部隊的命中率。6級「明目石」可使部隊的命中率+6。